物理のバス停 by salt22g

とある物理学見習いの備忘録。

機械学習

VS Code + Docker + GPUサーバーによる開発環境の設定 (Tiny ImageNetを題材に)

目的 学生ゼミの課題を題材にVS Codeを用いたサーバーへのログインDockerでの作業手順のチュートリアルを作成する。Tiny imagenetについてはスタンフォード大の以下のページを参照してください。 cs231n.stanford.edu Tiny ImageNet https://medium.com/@lok…

分散共分散行列で定義された楕円体の断面算出

ある生物の神経細胞画像データを機械学習解析で使える形として抽出する。アノテーションのデータがMATLABで解析されたファイルで与えられていた。 github.com figshare.com .matファイルから辞書データとして抜き出したところ、細胞の形が中心の座標と三次元…

PyTorch-Lightningのチュートリアルがちゃんと動かない

チュートリアルが動かない?意味ねえじゃん 結論から言うと最初の実行セルを !pip install segmentation-models-pytorch # !pip install pytorch-lightning==1.5.4 !pip install pytorch-lightning==1.9.5 と変更すればよかった。 以下のチュートリアルをgoo…

自前のMask画像からCOCO format jsonを作成

手作業でAnnotationなんてやってられるか!!! ということで、画像処理でcoco formatのjsonを作るscriptを書きました。 簡易的なのでぜひ改造して使ってください。ただしMask情報が二値化画像で取得できている前提です。 そもそも二値化できるなら物体検出…